治疗龋齿的主要方法是充填。即将龋坏组织去除净，作成一定的洞形，清洗、消毒以后，用充填材料（filling materrial）填初，并恢复牙齿缺损的外形，龄坏即可不继续发展。浅龋充填效果最好。中龋和深龋的治疗，在去净龋坏组织以后，有时洞底已接近牙髓，就需要在洞底加一层护髓剂再填初。有时深龋在去净龋坏组织以后牙髓就暴露了，就需要先采取牙髓治疗，然后才能填初。充填材料主要用银汞合金（amalgam）或复合充填树脂（composite resin）。乳牙因要换牙，可以用玻璃离子水门汀（glass sonomer cement）填补（暂时性充填材料）。
没有形成龋洞的衩期龋，可以用药物治疗的方法，能达到一定的疗效。恒虐待常用氟化钠糊剂涂擦龋损；乳牙可用氟化双胺银（涂擦后有变色，故不用于恒牙）。涂药治疗后，仍可能复发，需要每半年复查一次。因此，治疗龋齿，愈早愈好。